- الدورة الثالثة (غزة 20-24 أيار /مايو 1966 م:
نوقشت في هذه الدورة مسألة فصل رئاسة المجلس الوطني عن رئاسة منظمة التحرير الفلسطينية، وتم الاتفاق على تنفيذ ذلك بدءا من الدورة القادمة وزيادة أعضاء المجلس إلى (466) عضوا بدلا من (397).وتعد قرارات هذه الدورة خطوة هامة وقفزة نوعية في سجل المجلس مقارنة مع قرارات الدورتين السابقتين والتي كانت تأخذ طابع التعميم نظرا لمتطلبات مرحلة الإنشاء والتجهيز للمنظمة ولأجهزتها ،في حين أن المنظمة في هذه الدورة حققت إنجازات محلية وإقليمية ودولية أصبحت في العالم أكثر وضوحا وعلاقاتها مع دول العالم أكثر تحديدا .
من أبرز قرارات هذه الدورة ,موزعة حسب مجالاتها :
1.حرية العمل الفلسطيني:إن هذه الحرية ضرورية لخوض معركة التحرير، والمطالبة بالإفراج فورا عن المعتقلين الوطنيين الفلسطينيين ووقف أعمال الإبعاد ضد الفلسطينيين في كل مكان، والطلب إلى الدول العربية منح الفلسطينيين حريتهم في شؤون العمل والسفر والإقامة.
2.وحدة العمل الثوري: ضرورة توحيد جميع منظمات وفصائل العمل الفدائي في إطار المنظمة الأم ، وتكليف رئيس المنظمة التعاون مع هذه القوى لإنجاز الوحدة .
3.العمل العربي المشترك: طالب المجلس الدول العربية أن تلتزم بما قررته مؤتمرات القمة كحد أدنى للعمل العربي الموحد.
4.البترول : قرر المجلس ضرورة استخدام البترول العربي سلاحا أساسيا من أسلحة المعركة لاسترداد الوطن السليب .
5.السلاح الذري والمعركة الإستباقية : يحذر المجلس من جهود إسرائيل في إنتاج السلاح الذري ،وان من الضروري على الدول العربية خوض المعركة الإستباقية مع إسرائيل لمنها من الحصول على السلاح الذري .
6.جيش التحرير الفلسطيني : كان المجلس في دورته الأولى قد وافق بعد مناقشات طويلة على إنشاء كتائب فلسطينية بسبب اعتراض إحدى الدول العربية على إنشاء جيش التحرير الفلسطيني بقيادة واحدة ،إلا أنه في هذه الدورة تم تجاوز هذا الأمر وقرر المجلس تعديل المادة (22)كالتالي :تنشئ منظمة التحرير الفلسطينية جيشا من أبناء فلسطين يعرف بجيش التحرير الفلسطيني وتكون له قيادة مستقلة واجبه القومي أن يكون الطليعة في خوض معركة تحرير فلسطين .